MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli SE11 chromosome

Total Repeats: 89346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011415	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917192
2	NC_011415	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917192
3	NC_011415	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
4	NC_011415	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	209917193
5	NC_011415	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	209917193
6	NC_011415	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	209917193
7	NC_011415	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
8	NC_011415	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
9	NC_011415	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	209917193
10	NC_011415	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
11	NC_011415	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
12	NC_011415	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
13	NC_011415	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	209917193
14	NC_011415	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
15	NC_011415	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
16	NC_011415	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917193
17	NC_011415	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
18	NC_011415	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
19	NC_011415	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
20	NC_011415	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	209917193
21	NC_011415	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
22	NC_011415	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	209917193
23	NC_011415	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
24	NC_011415	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
25	NC_011415	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
26	NC_011415	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
27	NC_011415	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	209917193
28	NC_011415	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
29	NC_011415	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
30	NC_011415	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	209917193
31	NC_011415	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917193
32	NC_011415	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917193
33	NC_011415	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
34	NC_011415	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
35	NC_011415	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
36	NC_011415	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
37	NC_011415	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917193
38	NC_011415	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	209917193
39	NC_011415	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917193
40	NC_011415	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
41	NC_011415	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917193
42	NC_011415	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	209917193
43	NC_011415	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917193
44	NC_011415	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
45	NC_011415	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
46	NC_011415	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917193
47	NC_011415	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
48	NC_011415	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
49	NC_011415	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917193
50	NC_011415	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
51	NC_011415	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209917193
52	NC_011415	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
53	NC_011415	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917193
54	NC_011415	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	209917193
55	NC_011415	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
56	NC_011415	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917193
57	NC_011415	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917193
58	NC_011415	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917193
59	NC_011415	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
60	NC_011415	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
61	NC_011415	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917194
62	NC_011415	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917194
63	NC_011415	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	209917194
64	NC_011415	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917194
65	NC_011415	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917194
66	NC_011415	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
67	NC_011415	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917194
68	NC_011415	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917194
69	NC_011415	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	209917194
70	NC_011415	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
71	NC_011415	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917194
72	NC_011415	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	209917194
73	NC_011415	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	209917194
74	NC_011415	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917194
75	NC_011415	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	209917194
76	NC_011415	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209917194
77	NC_011415	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	209917194
78	NC_011415	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917194
79	NC_011415	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	209917195
80	NC_011415	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	209917195
81	NC_011415	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
82	NC_011415	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
83	NC_011415	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	209917195
84	NC_011415	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
85	NC_011415	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
86	NC_011415	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
87	NC_011415	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917195
88	NC_011415	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	209917195
89	NC_011415	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917195
90	NC_011415	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
91	NC_011415	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
92	NC_011415	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917195
93	NC_011415	AGCC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	209917195
94	NC_011415	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917195
95	NC_011415	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917195
96	NC_011415	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
97	NC_011415	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
98	NC_011415	CGC	2	6	4791	4796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
99	NC_011415	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	209917195
100	NC_011415	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917195
101	NC_011415	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917195
102	NC_011415	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917195
103	NC_011415	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917195
104	NC_011415	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917196
105	NC_011415	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917196
106	NC_011415	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917196
107	NC_011415	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917196
108	NC_011415	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917196
109	NC_011415	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917196
110	NC_011415	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209917196
111	NC_011415	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917196
112	NC_011415	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917196
113	NC_011415	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
114	NC_011415	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209917197
115	NC_011415	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917197
116	NC_011415	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917197
117	NC_011415	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	209917197
118	NC_011415	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917197
119	NC_011415	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917197
120	NC_011415	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917197
121	NC_011415	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917197
122	NC_011415	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917197
123	NC_011415	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
124	NC_011415	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917197
125	NC_011415	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917197
126	NC_011415	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209917197
127	NC_011415	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	209917197
128	NC_011415	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917197
129	NC_011415	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209917197
130	NC_011415	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917198
131	NC_011415	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
132	NC_011415	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917198
133	NC_011415	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917198
134	NC_011415	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917198
135	NC_011415	GCT	2	6	7111	7116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917198
136	NC_011415	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
137	NC_011415	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209917198
138	NC_011415	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	209917198
139	NC_011415	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917198
140	NC_011415	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917198
141	NC_011415	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	209917198
142	NC_011415	TCC	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209917198
143	NC_011415	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917198
144	NC_011415	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	209917198
145	NC_011415	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209917198
146	NC_011415	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209917198
147	NC_011415	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	209917198
148	NC_011415	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	209917198
149	NC_011415	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917199
150	NC_011415	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	209917199
151	NC_011415	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	209917199
152	NC_011415	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	209917199
153	NC_011415	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	209917199
154	NC_011415	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
155	NC_011415	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	209917199
156	NC_011415	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
157	NC_011415	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	209917199
158	NC_011415	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
159	NC_011415	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917199
160	NC_011415	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
161	NC_011415	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209917199
162	NC_011415	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	209917199
163	NC_011415	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917199
164	NC_011415	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917199
165	NC_011415	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
166	NC_011415	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917199
167	NC_011415	A	6	6	9165	9170	100 %	0 %	0 %	0 %	209917199
168	NC_011415	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917199
169	NC_011415	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209917200
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171	NC_011415	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917200
172	NC_011415	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209917200
173	NC_011415	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	209917200
174	NC_011415	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917200
175	NC_011415	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917200
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182	NC_011415	CAG	2	6	10080	10085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917201
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184	NC_011415	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917201
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192	NC_011415	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	209917202
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198	NC_011415	TTC	2	6	10973	10978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917202
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215	NC_011415	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	209917204
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248	NC_011415	CTG	2	6	13785	13790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917204
249	NC_011415	GAA	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917204
250	NC_011415	GAC	2	6	13839	13844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917204
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252	NC_011415	CAG	2	6	13968	13973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917204
253	NC_011415	CAG	3	9	13983	13991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209917204
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257	NC_011415	A	6	6	14070	14075	100 %	0 %	0 %	0 %	209917204
258	NC_011415	ATT	2	6	14180	14185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209917205
259	NC_011415	ACC	2	6	14261	14266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209917205
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262	NC_011415	GCG	3	9	14405	14413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917205
263	NC_011415	GGC	3	9	14419	14427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917205
264	NC_011415	GGC	2	6	14473	14478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917205
265	NC_011415	GTC	2	6	14486	14491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209917205
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267	NC_011415	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	209917205
268	NC_011415	GAA	2	6	14542	14547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209917205
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270	NC_011415	TTC	2	6	14692	14697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209917205
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291	NC_011415	GCG	2	6	16230	16235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209917207
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386	NC_011415	T	7	7	21538	21544	0 %	100 %	0 %	0 %	209917211
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